More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1253 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 321 aa  627  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  64.26 
 
 		 313 aa  332  7.000000000000001e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  55.48 
 
 		 317 aa  288  9e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  55.59 
 
 		 321 aa  269  4e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  55.37 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  50.31 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  52.73 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  53.48 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  49.52 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  44.3 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  46.45 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  43.81 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  43.69 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  41.18 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  44.34 
 
 		 271 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  46.08 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  45.6 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 272 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  45.31 
 
 		 282 aa  175  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  45.57 
 
 		 270 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  43.23 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  44.77 
 
 		 273 aa  170  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  39.56 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  42.47 
 
 		 290 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  40.32 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 279 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 289 aa  152  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 271 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  39.74 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  38.94 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  38.17 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  40.45 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.01 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.71 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  29.71 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.45 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  33.75 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  29.71 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  35.26 
 
 		 280 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.18 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  33.97 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  33.74 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  29.34 
 
 		 279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  33.65 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  29.56 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  30.48 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  29.56 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  29.56 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  29.56 
 
 		 275 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 277 aa  109  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  30.57 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  30.23 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  28.43 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 292 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  27.01 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  30.09 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  28.71 
 
 		 276 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  30.75 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  31.31 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  34.54 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  32.19 
 
 		 287 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  30.28 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  29.62 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  27.48 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  27.51 
 
 		 272 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  27.51 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  29.25 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  29.25 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  29.62 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32.74 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  31.65 
 
 		 282 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  29.64 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.92 
 
 		 277 aa  104  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  28.03 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  29.3 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 274 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  31.48 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  30.86 
 
 		 261 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  30.03 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 278 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  29.87 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  31.66 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  32.06 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>