More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2438 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  55.08 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  54.03 
 
 		 314 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 314 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  59.02 
 
 		 313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  55.27 
 
 		 319 aa  249  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  49.02 
 
 		 304 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  51.97 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  55.37 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  48.16 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  42.11 
 
 		 280 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  39.94 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  45.18 
 
 		 282 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  44.82 
 
 		 273 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  40.72 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  47.51 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  42.38 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  42.53 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  43.56 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  43.85 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 271 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  41.69 
 
 		 279 aa  159  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  43.29 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  44 
 
 		 270 aa  158  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 293 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 289 aa  152  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  43.67 
 
 		 307 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  41.14 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  42.23 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  40.39 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.12 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  29.67 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.92 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  33.01 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  35.5 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.59 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  35.88 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 277 aa  99.8  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  28.8 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  28.71 
 
 		 286 aa  99.4  8e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  34.3 
 
 		 294 aa  99  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.47 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 257 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  30.34 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  28.06 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  30.99 
 
 		 281 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  29.45 
 
 		 284 aa  96.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  26.89 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  34.8 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 309 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  32.12 
 
 		 278 aa  95.5  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  29.49 
 
 		 277 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  27.71 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.67 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  29.28 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  35.22 
 
 		 296 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  28.9 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  30.65 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  27.41 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  34.33 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  29.28 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  27.07 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  31.92 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  31.07 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 284 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  31.64 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 289 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 		 262 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 295 aa  92.4  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  31.95 
 
 		 382 aa  92.4  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  28.85 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  32.7 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  28.19 
 
 		 284 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  25.82 
 
 		 260 aa  91.3  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  29.26 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>