More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1623 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  50.9 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  51.81 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 273 aa  206  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  46.71 
 
 		 317 aa  201  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  48.21 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 302 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  47.1 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  48.23 
 
 		 280 aa  196  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  45.3 
 
 		 314 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  47.52 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  45 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  46.85 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  43.1 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  43.23 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 272 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  47.35 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  45.92 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  42.19 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  46.03 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  43.65 
 
 		 321 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  46.98 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  46.61 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  41.83 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  40.72 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  37.11 
 
 		 293 aa  152  8e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  35.52 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 295 aa  142  8e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  36.08 
 
 		 281 aa  142  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 279 aa  138  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  31.97 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 296 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.55 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  31.63 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 292 aa  135  9e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  31.97 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  34.34 
 
 		 334 aa  133  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.31 
 
 		 276 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 288 aa  132  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  34.71 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  37.02 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  35.33 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  32.18 
 
 		 276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  35.67 
 
 		 299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.33 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  34.55 
 
 		 407 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.86 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  34.13 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  35.22 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>