More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3281 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 273 aa  537  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  67.04 
 
 		 270 aa  334  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  67.41 
 
 		 268 aa  332  5e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  62.45 
 
 		 274 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  59.26 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  55.91 
 
 		 272 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  60.85 
 
 		 302 aa  258  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  56.34 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  54.41 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  58.21 
 
 		 307 aa  244  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  55.79 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  53.15 
 
 		 289 aa  242  5e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  54.2 
 
 		 289 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  51.65 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  58.11 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  52.08 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  52.08 
 
 		 293 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  51.74 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  51.23 
 
 		 289 aa  224  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  50.87 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  52.46 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 293 aa  214  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  52.98 
 
 		 290 aa  209  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  53.05 
 
 		 279 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  46.3 
 
 		 319 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  49.83 
 
 		 304 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  53.43 
 
 		 282 aa  202  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  49.16 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  46.15 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  46.47 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  45.82 
 
 		 309 aa  178  8e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  41.86 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  40.58 
 
 		 314 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.7 
 
 		 355 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  43.59 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 283 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  35.49 
 
 		 368 aa  136  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.54 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 279 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  36.7 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  39.31 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.4 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  36.7 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 281 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 275 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  32.84 
 
 		 286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.29 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.49 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  35.49 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 275 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  31.48 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.63 
 
 		 334 aa  125  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 292 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 291 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  30.21 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  30.48 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  31.91 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  29.86 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  35.15 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  35.15 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  32.54 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  32.77 
 
 		 407 aa  123  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  31.71 
 
 		 274 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  34.83 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  35.55 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  32.53 
 
 		 278 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  34.03 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  34.24 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  34.24 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>