More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2435 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 289 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  79.58 
 
 		 289 aa  435  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  78.82 
 
 		 289 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  77.66 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  77.66 
 
 		 293 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  77.32 
 
 		 313 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  58.16 
 
 		 302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  60.79 
 
 		 290 aa  278  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  53.21 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  50.51 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  53.98 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  52.98 
 
 		 273 aa  242  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  50.87 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  49.3 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  51.03 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  46.83 
 
 		 271 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  47.78 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  48.43 
 
 		 302 aa  205  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  47.6 
 
 		 307 aa  201  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  41.81 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  47.57 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  46.07 
 
 		 271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 313 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  46.31 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  40.95 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  39.77 
 
 		 314 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  40.19 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  41.21 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  40.39 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  37.16 
 
 		 297 aa  136  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  41.48 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.02 
 
 		 284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 254 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  32.33 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.44 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  28.38 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  33.87 
 
 		 296 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  28.14 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  32.29 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  27.03 
 
 		 292 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  27.8 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  31.5 
 
 		 274 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 269 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  29.15 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.35 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  31.31 
 
 		 280 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  30.36 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.04 
 
 		 277 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  25.84 
 
 		 286 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  27.12 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  31.73 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  30.26 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  32.11 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  27.74 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  31.96 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  29.25 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  32.36 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  28.81 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  29.21 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.3 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  32.36 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  31.77 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  31.37 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  29.97 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  30.63 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  35.37 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  29.97 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  28.08 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  28.08 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  28.08 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  28.08 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 279 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  27.93 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  29.59 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  29.59 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  28.39 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  28.83 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  27.01 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>