More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2989 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  45.94 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  39.35 
 
 		 283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  41.7 
 
 		 269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 284 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  35.59 
 
 		 407 aa  186  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 279 aa  182  6e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  39.01 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 323 aa  178  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  38.3 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  36.68 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  38.21 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 277 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 274 aa  175  6e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 278 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  34.13 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  37.11 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 288 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 277 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  39.38 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  38.6 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 279 aa  169  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  34.45 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  38.21 
 
 		 276 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  38.36 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 315 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  38.21 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  31.94 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 		 279 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 277 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.91 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  37.98 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2337  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 291 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 274 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 276 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 276 aa  153  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>