More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1464 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 314 aa  633    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  82.48 
 
 		 314 aa  496  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  65.31 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  57.57 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  53.9 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  54.03 
 
 		 309 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  48.68 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  51.49 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  52.23 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  45.64 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  45.33 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  48.74 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  44.07 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  43.79 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  44.9 
 
 		 282 aa  175  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  42.28 
 
 		 274 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  42.41 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  38.74 
 
 		 297 aa  170  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  44.82 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  44.48 
 
 		 285 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  41.33 
 
 		 268 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  43.14 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  41.72 
 
 		 277 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  41.47 
 
 		 272 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  43 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  39.46 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  37.39 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  37.66 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  37.66 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 289 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  38.34 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  40.16 
 
 		 290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.81 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 282 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  32.24 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  34.2 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.82 
 
 		 281 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  34.04 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 277 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 295 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.24 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.12 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  34.25 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  32.77 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 279 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 281 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 368 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  32.83 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  31.35 
 
 		 274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  31.51 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  33.99 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  33.97 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  36.21 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.11 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  33 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  32.12 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  32.67 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  30.46 
 
 		 275 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  30.03 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  30.03 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  30.03 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  30.03 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  30.61 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  31.37 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  32.33 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>