More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1131 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 270 aa  533  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  74.81 
 
 		 268 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  70.74 
 
 		 273 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  58.84 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  57.45 
 
 		 278 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  56.62 
 
 		 272 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  56.3 
 
 		 274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  56.51 
 
 		 271 aa  270  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  59.06 
 
 		 302 aa  263  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  57.14 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  54.85 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  52.3 
 
 		 289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  54.64 
 
 		 289 aa  249  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  52.45 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  56.55 
 
 		 271 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  52.45 
 
 		 293 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  52.1 
 
 		 313 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  58.15 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  51.24 
 
 		 289 aa  236  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  52.71 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  48.77 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  51.81 
 
 		 293 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  51.94 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  46.02 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  51.27 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  46.36 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  46.82 
 
 		 317 aa  201  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  45.92 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  47.68 
 
 		 313 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  51.99 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  45.73 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  44.82 
 
 		 314 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  44 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  42.43 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  36.93 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 278 aa  155  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  45.63 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  34.6 
 
 		 334 aa  146  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 280 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 277 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 277 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  37.12 
 
 		 292 aa  141  9e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.93 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  37.12 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  33.91 
 
 		 277 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  35.35 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 		 283 aa  139  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  34.12 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  33.91 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 		 292 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  34.27 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  34.27 
 
 		 278 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.05 
 
 		 368 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  35.52 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  35.04 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 279 aa  132  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.23 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 274 aa  132  7.999999999999999e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3249  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  37.21 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 286 aa  129  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  37.73 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  34.12 
 
 		 407 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 299 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  34.55 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>