More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0657 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 254 aa  500  1e-140  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  37.16 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 289 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  35.41 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  39.83 
 
 		 293 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  29.86 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  29.17 
 
 		 277 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.83 
 
 		 334 aa  114  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  37.73 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.88 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  32.85 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.58 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 286 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 281 aa  111  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  31.09 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  29.39 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  37.58 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  38.66 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  28.11 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  30.22 
 
 		 281 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.22 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 		 304 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  29.84 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.68 
 
 		 279 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.98 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  33.72 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 278 aa  106  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  28.85 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  32.48 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  29.24 
 
 		 285 aa  105  5e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  37.79 
 
 		 272 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  30.68 
 
 		 282 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  30.63 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 279 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  34.73 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 287 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  33.71 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  36.39 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  34.38 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  29.35 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  29.37 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  29.29 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  33.98 
 
 		 279 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 290 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  31.74 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  34.95 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 278 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  32.08 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  32.87 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  32.23 
 
 		 274 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 277 aa  101  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  31.13 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  32.1 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  31.16 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  33.99 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  30.43 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>