More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0181 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 272 aa  560  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  66.54 
 
 		 268 aa  364  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  65.02 
 
 		 266 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  61.89 
 
 		 268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  58.65 
 
 		 270 aa  330  2e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  60.69 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  60.38 
 
 		 256 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  40.96 
 
 		 260 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  44.98 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  42.34 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  40.59 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 261 aa  179  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  43.12 
 
 		 261 aa  178  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  39.48 
 
 		 258 aa  159  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  37.05 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  34.51 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 274 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 276 aa  138  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  32.41 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.88 
 
 		 334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  36.56 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  32.5 
 
 		 278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  34.64 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  30.93 
 
 		 286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  34.42 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  34.06 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  32.04 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 281 aa  129  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0407  diaminopimelate epimerase  32.74 
 
 		 277 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0431  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 283 aa  128  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  31.97 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  32.12 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  32.29 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  31.47 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3256  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.220746  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  32.65 
 
 		 288 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3249  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  31.2 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  32.06 
 
 		 278 aa  125  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  30.47 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  32.21 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  31.1 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 		 249 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  31.16 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  30.69 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  32.06 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  30.47 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>