More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0208 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 261 aa  544  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  51.16 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  50.19 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  49.22 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  50.19 
 
 		 257 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  48.67 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  49.03 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  49.43 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  46.59 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  41.35 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  41.86 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  43.12 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  41.91 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  41.39 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  42.32 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  36.24 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 277 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  36.76 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 280 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  33.94 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  32.53 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  32.19 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32.32 
 
 		 334 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.41 
 
 		 282 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  30.66 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  32.39 
 
 		 277 aa  121  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 323 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.56 
 
 		 279 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  31.14 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  32.74 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  30.56 
 
 		 281 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  32.01 
 
 		 282 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  29.9 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  32.39 
 
 		 355 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  32.07 
 
 		 368 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0137  diaminopimelate epimerase  30.17 
 
 		 292 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  29.33 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  28.77 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 283 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  30.43 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  30.03 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  30.72 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  31.9 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  29.86 
 
 		 282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  29.69 
 
 		 288 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  29.35 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  31.36 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  31.49 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  30.1 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  29.58 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  29.37 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  29.18 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  28.67 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  29.21 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  30.28 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  30.39 
 
 		 284 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  30.07 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  31.95 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  28.87 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  28.87 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  28.87 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  28.87 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  29.21 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  29.29 
 
 		 315 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 		 284 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 278 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  28.07 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  29.31 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  29.72 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  29.29 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>