More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0273 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 264 aa  547  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  67.84 
 
 		 256 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  62.36 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  60.69 
 
 		 272 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  59.09 
 
 		 266 aa  332  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  59.02 
 
 		 268 aa  322  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  56.27 
 
 		 270 aa  312  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  40.66 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  45.11 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  40.67 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 287 aa  185  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  42.16 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  40.38 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  39.55 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  36.63 
 
 		 282 aa  158  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  34.64 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  35.49 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 292 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  36.6 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 315 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 272 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 282 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 282 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 276 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 304 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 283 aa  143  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  32.5 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  33.92 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 275 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 288 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 277 aa  141  9e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  37.04 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  32.85 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0407  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  31.91 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0431  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 290 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  33.98 
 
 		 247 aa  139  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  31.91 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.32 
 
 		 280 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 274 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>