More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1798 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 283 aa  580  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  69.45 
 
 		 282 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  65.7 
 
 		 282 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  55.93 
 
 		 279 aa  295  8e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  56.13 
 
 		 281 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  43.8 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  44.04 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  38.77 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  38.46 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  37 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 268 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 264 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  36.56 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  35.29 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  34.7 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  39.21 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 278 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 290 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  35.04 
 
 		 261 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 277 aa  142  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 279 aa  139  6e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 282 aa  138  8.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  35.52 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  34.77 
 
 		 308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  36.19 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  31.53 
 
 		 295 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  40.08 
 
 		 273 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  34.22 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  33.84 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 278 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 286 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 284 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  31.71 
 
 		 304 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 		 280 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 278 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 355 aa  129  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  30.63 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  32.06 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  31.5 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.51 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  32.38 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  34.11 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  33.94 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  32.17 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  40.55 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  30.92 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  29.97 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 		 289 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  33 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 289 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  33.99 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 387 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>