More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0259 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  61.76 
 
 		 272 aa  346  3e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  61.9 
 
 		 275 aa  334  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  57.88 
 
 		 274 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  56.2 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  54.65 
 
 		 279 aa  265  5e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  34.81 
 
 		 295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  42.12 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  40.35 
 
 		 280 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 278 aa  161  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  35.13 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  35.21 
 
 		 282 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  38.6 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  38.51 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  39.81 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 277 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  38.6 
 
 		 355 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  32.38 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  38.18 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  41.37 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  38.77 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  32.38 
 
 		 277 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 279 aa  151  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  37.29 
 
 		 292 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  39.21 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  37.67 
 
 		 286 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  36.2 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 283 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  36.64 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 266 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  36.21 
 
 		 292 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 278 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  37.33 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0129  diaminopimelate epimerase  34.9 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0648318 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.16 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  37.19 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 295 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 279 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  33.95 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  33.94 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  35.52 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  35.92 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  34.43 
 
 		 288 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>