More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0063 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
273 aa  549  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 
274 aa  145  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  38.22 
 
 
264 aa  135  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  40.08 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  37.56 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  34.41 
 
 
260 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  39.52 
 
 
259 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  35.83 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  41.77 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  37.44 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  39.59 
 
 
257 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 
279 aa  125  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.36 
 
 
282 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  35.4 
 
 
275 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  39 
 
 
278 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 
275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 
275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 
275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 
275 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  34.05 
 
 
272 aa  122  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  33.72 
 
 
284 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  33.85 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  34.94 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  34.85 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  40.08 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  37.94 
 
 
277 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  34.07 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  34.07 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  34.05 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 
278 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  35.18 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.32 
 
 
281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  37.65 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  32.58 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  34.75 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  33.59 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  32.16 
 
 
277 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.07 
 
 
279 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  34.85 
 
 
278 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  32.96 
 
 
272 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  37.78 
 
 
276 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  32.23 
 
 
261 aa  112  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  33.94 
 
 
334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  34.05 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.1 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.87 
 
 
280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  30.6 
 
 
285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 
308 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 
368 aa  108  7.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 
276 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 
274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  30.88 
 
 
281 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 
274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 
274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  29.64 
 
 
274 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 
274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  34.36 
 
 
274 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 
274 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 
270 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  35.18 
 
 
274 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 
274 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  31.64 
 
 
268 aa  106  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 
260 aa  106  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  33.6 
 
 
274 aa  106  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 
274 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.17 
 
 
280 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  34.36 
 
 
274 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 
355 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  29.23 
 
 
277 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  34.96 
 
 
264 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 
261 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  37.3 
 
 
278 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  32.59 
 
 
277 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  35.16 
 
 
256 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  31.82 
 
 
249 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  31.7 
 
 
287 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 
232 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  29.71 
 
 
281 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  31.03 
 
 
407 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  36.94 
 
 
282 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>