More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0339 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  97.84 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  83.51 
 
 		 282 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  84.06 
 
 		 278 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  83.87 
 
 		 282 aa  487  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  84.53 
 
 		 278 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  78.83 
 
 		 279 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  78.06 
 
 		 278 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  57.71 
 
 		 280 aa  329  4e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  58.7 
 
 		 280 aa  326  2.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  56.63 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  55.16 
 
 		 287 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  52.69 
 
 		 277 aa  304  9.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  52.69 
 
 		 277 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  54.12 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  52.33 
 
 		 277 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  54.87 
 
 		 284 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  51.61 
 
 		 292 aa  300  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  54.41 
 
 		 288 aa  289  4e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  54.44 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  54.04 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  54.04 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  54.04 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  54.04 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  54.04 
 
 		 288 aa  287  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  48.36 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  54.04 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 		 288 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 		 288 aa  284  9e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  51.07 
 
 		 279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  53.07 
 
 		 278 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  52.86 
 
 		 279 aa  278  6e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  51.08 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 279 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  49.28 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 279 aa  243  3e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 280 aa  239  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  43.22 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 280 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  43.97 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  43.97 
 
 		 281 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 290 aa  223  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.42 
 
 		 277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 289 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  44.2 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 276 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  41.32 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  41.38 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  42.52 
 
 		 407 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  41.32 
 
 		 287 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  41.34 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  40.99 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 279 aa  208  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  42.55 
 
 		 283 aa  208  9e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  40.56 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 292 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 368 aa  205  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0859  diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 275 aa  204  9e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  40.35 
 
 		 355 aa  204  9e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 284 aa  204  9e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  39.07 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  39.3 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>