More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A5076 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  97.57 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  97.57 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  97.57 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  98.26 
 
 
288 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  97.22 
 
 
288 aa  580  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  97.22 
 
 
288 aa  579  1e-164  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  97.22 
 
 
288 aa  579  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  96.88 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  96.18 
 
 
288 aa  569  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  92.36 
 
 
288 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  70.07 
 
 
284 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  62.81 
 
 
290 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  52.31 
 
 
279 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  51.08 
 
 
277 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 
282 aa  286  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 
277 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 
278 aa  285  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  53.31 
 
 
278 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  54.07 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  51.48 
 
 
278 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 
278 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  53 
 
 
282 aa  279  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 
277 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 
292 aa  277  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  48.74 
 
 
284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 
280 aa  273  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  45.45 
 
 
283 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 
278 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 
278 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  47.18 
 
 
304 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 
279 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 
278 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  46.43 
 
 
280 aa  256  4e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  45.96 
 
 
287 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  46.45 
 
 
284 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  46.32 
 
 
279 aa  240  2e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 
279 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 
280 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  39.29 
 
 
274 aa  210  3e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 
281 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 
281 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 
276 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  43.31 
 
 
278 aa  205  8e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  38.91 
 
 
269 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 
280 aa  202  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  39.45 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  38.73 
 
 
277 aa  198  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  40.35 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 
275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  39.37 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  40.69 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  40 
 
 
276 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 
368 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 
308 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 
277 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 
290 aa  193  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 
288 aa  193  3e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 
281 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  37.58 
 
 
407 aa  193  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 
295 aa  193  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 
295 aa  192  5e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 
297 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 
289 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  40.61 
 
 
287 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  39.16 
 
 
276 aa  190  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  38.75 
 
 
289 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 
288 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  38.75 
 
 
309 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  38.75 
 
 
309 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 
286 aa  188  7e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 
278 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 
289 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 
289 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 
309 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 
289 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 
289 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 
289 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  38.36 
 
 
289 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  40.99 
 
 
276 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 
286 aa  185  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 
387 aa  185  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  38.36 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 
289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 
278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  37.81 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  40.99 
 
 
276 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  37.24 
 
 
286 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  37.89 
 
 
355 aa  183  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>