More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35896 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  100 
 
 		 407 aa  826    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  60.76 
 
 		 282 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  61.3 
 
 		 281 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  60.96 
 
 		 281 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  59.17 
 
 		 279 aa  349  5e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  58.62 
 
 		 280 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  59.79 
 
 		 278 aa  340  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  57.09 
 
 		 281 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  55.71 
 
 		 280 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  50.33 
 
 		 334 aa  285  9e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  48.62 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  47.24 
 
 		 355 aa  262  6.999999999999999e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  47.6 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  46.28 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  47.42 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 323 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  48.28 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 292 aa  245  8e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  45.14 
 
 		 277 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  46.9 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  45.14 
 
 		 277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  45.33 
 
 		 274 aa  243  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  44.79 
 
 		 277 aa  243  5e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 284 aa  242  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 278 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 286 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 287 aa  239  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  44.18 
 
 		 284 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 279 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  43.54 
 
 		 278 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  43.1 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  40.62 
 
 		 281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  41.95 
 
 		 286 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 278 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  43.15 
 
 		 279 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  43.54 
 
 		 282 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 276 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 269 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  45.36 
 
 		 279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 278 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  42.27 
 
 		 278 aa  219  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  41.84 
 
 		 286 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 282 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 276 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  39.3 
 
 		 274 aa  218  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  39.45 
 
 		 275 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 284 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  39.38 
 
 		 275 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 284 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 275 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 275 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  39.45 
 
 		 275 aa  215  9e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  40.48 
 
 		 276 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  40.33 
 
 		 315 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.41 
 
 		 277 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  41.24 
 
 		 279 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 278 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 		 275 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 		 275 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  42.52 
 
 		 278 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 		 275 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 		 275 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  41.5 
 
 		 292 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 277 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  40.82 
 
 		 280 aa  213  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  41.44 
 
 		 276 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  38.64 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.59 
 
 		 286 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  38.64 
 
 		 289 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  42.66 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  40.68 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 283 aa  209  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  41.5 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.54 
 
 		 304 aa  208  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0040  diaminopimelate epimerase  40.77 
 
 		 275 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  38.44 
 
 		 299 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  40.7 
 
 		 276 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  38.75 
 
 		 282 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  38.36 
 
 		 288 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  38.83 
 
 		 289 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  43.45 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 292 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 291 aa  204  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  39.18 
 
 		 289 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  43.45 
 
 		 276 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  39.39 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  38.51 
 
 		 288 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  41.95 
 
 		 296 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  42.41 
 
 		 276 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 290 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>