More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1015 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  50.91 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  48.92 
 
 		 281 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  48.56 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  48.56 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 279 aa  268  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  50.37 
 
 		 278 aa  266  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 283 aa  263  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  46.93 
 
 		 284 aa  258  9e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  48.36 
 
 		 280 aa  257  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  46.74 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  47.31 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  46.38 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  48.72 
 
 		 280 aa  251  7e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  47.64 
 
 		 277 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  48.56 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 279 aa  249  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  47.27 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  47.12 
 
 		 278 aa  248  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  47.1 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  46.91 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  46.91 
 
 		 278 aa  247  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  44.2 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 287 aa  245  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  44.2 
 
 		 278 aa  245  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  45.33 
 
 		 407 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  46.43 
 
 		 368 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 279 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 278 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  44.32 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 280 aa  226  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  42.14 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 284 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 279 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  45.72 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  42.75 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  45.14 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  39.29 
 
 		 288 aa  210  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 284 aa  208  8e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  208  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  40.73 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 288 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  42.12 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 290 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.66 
 
 		 277 aa  205  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 292 aa  205  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  38.73 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  40.34 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  39.29 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 295 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 289 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  38.35 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  41.55 
 
 		 293 aa  194  9e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  41.01 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  38.83 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 309 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 291 aa  192  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 295 aa  192  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  40.66 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 292 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  38.79 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 387 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 282 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  39.03 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  36.26 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>