More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2115 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 284 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  58.89 
 
 		 269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  51.99 
 
 		 277 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  52.65 
 
 		 283 aa  294  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  49.09 
 
 		 278 aa  290  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  48.36 
 
 		 278 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  48 
 
 		 278 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  48.19 
 
 		 282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  47.46 
 
 		 279 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  48.19 
 
 		 282 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  46.93 
 
 		 278 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  48.55 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  48.19 
 
 		 280 aa  267  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 280 aa  265  7e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  47.83 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  47.46 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  47.1 
 
 		 277 aa  256  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 288 aa  255  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 288 aa  255  6e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  45.99 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  47.12 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  45.04 
 
 		 281 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 288 aa  248  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  45.16 
 
 		 282 aa  245  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  43.93 
 
 		 279 aa  245  6.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  47.31 
 
 		 284 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  46.07 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  46.74 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 272 aa  241  9e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 280 aa  240  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  42.61 
 
 		 407 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 287 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  45.32 
 
 		 290 aa  234  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  42.55 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  42.4 
 
 		 355 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  43.42 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  43.27 
 
 		 279 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  45.94 
 
 		 285 aa  225  7e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 284 aa  219  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 277 aa  219  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  41.01 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  43.3 
 
 		 334 aa  215  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  40.35 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  42.24 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  43.99 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  43.05 
 
 		 299 aa  212  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  42.31 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  38.95 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  39.21 
 
 		 290 aa  204  9e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  39.3 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  41.32 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  41.4 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  42.45 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  39.04 
 
 		 292 aa  202  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 287 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  37.98 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  40.86 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  38.35 
 
 		 287 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 288 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>