More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0322 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  99.3 
 
 		 284 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  52.86 
 
 		 284 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 323 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  47.29 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  46.24 
 
 		 355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  51.58 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  51.23 
 
 		 286 aa  261  8e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 286 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 279 aa  233  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  41.99 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  45.26 
 
 		 277 aa  231  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  44.91 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  45.26 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  43.97 
 
 		 278 aa  226  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 281 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  43.34 
 
 		 334 aa  225  6e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  45.17 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  42.11 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  41.03 
 
 		 407 aa  215  7e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  41.05 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  40.7 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.93 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 297 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  40.35 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.81 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  39.08 
 
 		 275 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  38.99 
 
 		 269 aa  198  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  34.74 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 286 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 269 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  36.68 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 288 aa  192  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  34.68 
 
 		 289 aa  192  6e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  34.93 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 285 aa  191  8e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  39.51 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  33 
 
 		 309 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  36.84 
 
 		 281 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  35.37 
 
 		 292 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 315 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 387 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 296 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  34.34 
 
 		 289 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  34.74 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  38.95 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 292 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  34.4 
 
 		 274 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  35.03 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  37.89 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  34.26 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>