More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0724 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  96.03 
 
 		 277 aa  552  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  95.31 
 
 		 277 aa  548  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  76.9 
 
 		 292 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  71.48 
 
 		 280 aa  418  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  54.77 
 
 		 287 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  54.51 
 
 		 304 aa  329  4e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  52.19 
 
 		 277 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  54.84 
 
 		 278 aa  311  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  54.68 
 
 		 279 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  55 
 
 		 278 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  53.21 
 
 		 282 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  53.21 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  52.35 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  52.69 
 
 		 278 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  52.69 
 
 		 278 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 283 aa  299  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  53.05 
 
 		 284 aa  295  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 288 aa  286  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 288 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  52.73 
 
 		 279 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  47.1 
 
 		 280 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  47.64 
 
 		 278 aa  278  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 		 279 aa  278  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 279 aa  268  8e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 279 aa  265  5e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  48.57 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 280 aa  261  6.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  47.83 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  45.17 
 
 		 284 aa  254  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 288 aa  254  8e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 308 aa  254  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 290 aa  252  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  44.41 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  47.14 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 277 aa  248  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 		 281 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  46.91 
 
 		 274 aa  247  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  46.04 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  44.79 
 
 		 407 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 		 284 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  42.55 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  45.92 
 
 		 334 aa  241  6e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  48.56 
 
 		 290 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  45.22 
 
 		 269 aa  241  7e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  41.84 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 277 aa  238  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  41.58 
 
 		 276 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  41.78 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 281 aa  236  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  41.49 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  41.78 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  41.78 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 274 aa  236  4e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  41.18 
 
 		 286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  41.44 
 
 		 309 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  41.44 
 
 		 289 aa  234  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  44.21 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  41.1 
 
 		 289 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  46.02 
 
 		 280 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  39.66 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  45.26 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 		 292 aa  228  6e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0137  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 292 aa  228  8e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  41.44 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  42.62 
 
 		 299 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  44.2 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 284 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>