More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1913 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 299 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  44.15 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  45.79 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  43.48 
 
 		 283 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  43.29 
 
 		 277 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 277 aa  231  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  42.95 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  43.67 
 
 		 284 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  41.55 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  43.29 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  43.48 
 
 		 280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  41.72 
 
 		 282 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  41.33 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  42.33 
 
 		 281 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  42.33 
 
 		 281 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  43.39 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  42.03 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  40.13 
 
 		 355 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  41.55 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  39.67 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 		 368 aa  208  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  39 
 
 		 280 aa  206  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  36.15 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 275 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  36.15 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  36.15 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  43.2 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 278 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  37.38 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.45 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  37.71 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  39.87 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  38.33 
 
 		 279 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  36.96 
 
 		 286 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  40.33 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  41.72 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  37.79 
 
 		 284 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.91 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  36.12 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  39.33 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  37.58 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  37.74 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  37.74 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  37.82 
 
 		 323 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  37.67 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  39.32 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 274 aa  187  3e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  37.46 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  35.1 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 289 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  35.91 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 276 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  37.38 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 309 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  34.55 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>