More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1814 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  99.26 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 272 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  49.61 
 
 		 269 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  42.39 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  39.42 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  39.05 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  38.69 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  38.16 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  39.05 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  40.73 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  35.94 
 
 		 278 aa  186  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  40.78 
 
 		 285 aa  184  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  38.27 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 282 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 297 aa  178  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 		 279 aa  178  9e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 288 aa  178  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  37.05 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  37.89 
 
 		 288 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  36.17 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 278 aa  176  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  39.19 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 290 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 277 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  39.18 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 279 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  40.88 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  36.96 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  37.81 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  36.97 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 292 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 288 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 355 aa  168  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 368 aa  168  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  37.05 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  35.4 
 
 		 407 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  35.23 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 279 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 292 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  37.55 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  34.91 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  35.36 
 
 		 279 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 276 aa  165  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 288 aa  165  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  32.51 
 
 		 292 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 276 aa  165  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  36.9 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  38.04 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  35.84 
 
 		 334 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  36.17 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 274 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>