More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3545 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
288 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  92.36 
 
 
288 aa  553  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  92.01 
 
 
288 aa  550  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  92.01 
 
 
288 aa  550  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  91.67 
 
 
288 aa  547  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  91.67 
 
 
288 aa  547  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  91.67 
 
 
288 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  91.67 
 
 
288 aa  547  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  91.67 
 
 
288 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  91.32 
 
 
288 aa  546  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  89.93 
 
 
288 aa  537  9.999999999999999e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  69.72 
 
 
284 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  62.81 
 
 
290 aa  361  9e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 
279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  53.6 
 
 
282 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  54.81 
 
 
278 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  51.97 
 
 
278 aa  289  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  54.44 
 
 
278 aa  288  6e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  53.68 
 
 
278 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 
277 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  51.48 
 
 
278 aa  287  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  52.33 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 
277 aa  281  9e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 
277 aa  280  2e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 
292 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  50.36 
 
 
280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  46.55 
 
 
283 aa  269  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  47.65 
 
 
284 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  48.2 
 
 
278 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  47.12 
 
 
280 aa  260  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  46.98 
 
 
304 aa  259  4e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 
278 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  50.36 
 
 
279 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  46.26 
 
 
284 aa  252  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 
278 aa  250  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  45.26 
 
 
287 aa  250  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  45.96 
 
 
279 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 
295 aa  225  6e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  48.58 
 
 
279 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 
274 aa  222  4.9999999999999996e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 
281 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 
282 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 
281 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  42.2 
 
 
279 aa  214  9e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 
278 aa  208  7e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 
277 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 
293 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 
269 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 
276 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 
275 aa  202  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 
308 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
277 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 
368 aa  199  6e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  42.16 
 
 
280 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  39.22 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 
295 aa  198  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  37.14 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  39.65 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  36.99 
 
 
407 aa  196  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 
289 aa  195  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 
290 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  38.06 
 
 
309 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  38.06 
 
 
288 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  38.62 
 
 
309 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  39.72 
 
 
288 aa  193  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  38.62 
 
 
309 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  39.37 
 
 
297 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 
279 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  41.34 
 
 
287 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  39.06 
 
 
326 aa  192  7e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  37.93 
 
 
289 aa  191  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 
289 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 
289 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 
289 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  41.34 
 
 
276 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 
289 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  38.01 
 
 
289 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  37.67 
 
 
289 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.77 
 
 
276 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 
387 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  38.54 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  37.24 
 
 
286 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  38.7 
 
 
287 aa  189  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 
286 aa  188  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  40 
 
 
334 aa  187  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  41.43 
 
 
276 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  37.67 
 
 
288 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  40.99 
 
 
276 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  40.99 
 
 
280 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  38.41 
 
 
288 aa  186  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.126589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>