More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1402 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1402  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 275 aa  550  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0816431  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2928  diaminopimelate epimerase  65.56 
 
 		 274 aa  322  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.276892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  61.98 
 
 		 268 aa  318  5e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0523  Diaminopimelate epimerase  48.76 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  51.3 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  47.21 
 
 		 267 aa  251  8.000000000000001e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  50.76 
 
 		 282 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2498  diaminopimelate epimerase  48.87 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0760107  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  46.07 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1415  diaminopimelate epimerase  52.13 
 
 		 293 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  50.76 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2809  diaminopimelate epimerase  49.07 
 
 		 275 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.241517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  46.57 
 
 		 278 aa  222  6e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0936  diaminopimelate epimerase  49.81 
 
 		 276 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2595  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2979  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0395  diaminopimelate epimerase  48.5 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.47994  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  44.4 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  45.55 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 281 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  43.68 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2776  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0505261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  44.8 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  46.55 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3404  diaminopimelate epimerase  43.86 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.410121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2720  diaminopimelate epimerase  48.07 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.991154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 292 aa  205  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0215  diaminopimelate epimerase  45.36 
 
 		 288 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.388683  normal  0.0159433 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  41.76 
 
 		 277 aa  204  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2947  Diaminopimelate epimerase  47.72 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 288 aa  203  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  43.07 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  41.2 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 279 aa  204  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  45 
 
 		 278 aa  202  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  44.96 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5335  diaminopimelate epimerase  47.55 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  40.85 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0372  diaminopimelate epimerase  46.43 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  40.88 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3656  diaminopimelate epimerase  47 
 
 		 293 aa  198  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0381626  hitchhiker  0.0055401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0095  diaminopimelate epimerase  38.81 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567794 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0359  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0251  diaminopimelate epimerase  45.71 
 
 		 293 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.185112  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0514  diaminopimelate epimerase  44.8 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.2458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0411  diaminopimelate epimerase  46.3 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  41.55 
 
 		 292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  44.72 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  44 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  41.72 
 
 		 288 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0183  diaminopimelate epimerase  47.18 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1850  Diaminopimelate epimerase  45.29 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  40.88 
 
 		 278 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  45.02 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  41.5 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  41.37 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  41.2 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  44.53 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  43.38 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1208  diaminopimelate epimerase  42.97 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  42.49 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2842  Diaminopimelate epimerase  45.94 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0231315  normal  0.30071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4629  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000265381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3575  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  41.11 
 
 		 286 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  39.22 
 
 		 304 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  42.36 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4868  diaminopimelate epimerase  44.41 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  41.91 
 
 		 277 aa  188  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  45.22 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>