More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3266 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 326 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  42.99 
 
 		 284 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  41.51 
 
 		 281 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 282 aa  218  7.999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  42.27 
 
 		 283 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  40.51 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  44.13 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  40.51 
 
 		 279 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  41.01 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  41.72 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  42.22 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 280 aa  205  9e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  40.06 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  40.48 
 
 		 355 aa  205  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  41.59 
 
 		 290 aa  203  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  44.76 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  40.31 
 
 		 282 aa  202  7e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 282 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  40.19 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  38.92 
 
 		 278 aa  196  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  36.94 
 
 		 278 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  40.37 
 
 		 323 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  39.56 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  38.44 
 
 		 284 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 277 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  38.92 
 
 		 278 aa  193  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  39.06 
 
 		 288 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  38.61 
 
 		 278 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  40.19 
 
 		 280 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  38.44 
 
 		 287 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  37.06 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  38.44 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 		 274 aa  186  5e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  41.12 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  37.81 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 288 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 288 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 288 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  37.19 
 
 		 288 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  37.19 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  42.77 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  36.31 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  36.51 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  38.82 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 		 277 aa  179  9e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  39.94 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 286 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  34.69 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.74 
 
 		 308 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  36.65 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  33.02 
 
 		 295 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  35.39 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  36.19 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  35.33 
 
 		 286 aa  165  9e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  36.28 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  36.28 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  36.28 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  36.28 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 289 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 289 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  35.96 
 
 		 275 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  34.56 
 
 		 293 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  37.61 
 
 		 296 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  35.65 
 
 		 275 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  37.2 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  35.33 
 
 		 275 aa  160  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  37.08 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  36.91 
 
 		 277 aa  159  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  34.38 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  29.69 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  37.61 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  38.68 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  36.47 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  37 
 
 		 387 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  38.68 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  37.31 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  36.47 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  36.47 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>