More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0171 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 286 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  53.05 
 
 		 285 aa  288  1e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0680  diaminopimelate epimerase  48.57 
 
 		 282 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2112  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  42.91 
 
 		 280 aa  231  8.000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3160  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000134357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3880  diaminopimelate epimerase  46.34 
 
 		 286 aa  221  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28993  normal  0.0214025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 277 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 278 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  41.45 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 278 aa  215  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  41.09 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2337  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  38.91 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  39.27 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 292 aa  208  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2751  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 268 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 		 287 aa  203  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  37.45 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  37.18 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3790  diaminopimelate epimerase  38.29 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 304 aa  201  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  39.85 
 
 		 269 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  38.63 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  37.32 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  35.16 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 288 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 276 aa  192  8e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  35.13 
 
 		 284 aa  191  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  36.69 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 288 aa  186  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  34.3 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 282 aa  185  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  32.49 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 309 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  33.22 
 
 		 407 aa  180  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 286 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  33.68 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 277 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  34.66 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 282 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 289 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 281 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  35.13 
 
 		 279 aa  178  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  38.75 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 280 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 292 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  39.19 
 
 		 272 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  34.15 
 
 		 289 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  39.19 
 
 		 272 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>