More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3880 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3880  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 286 aa  591  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28993  normal  0.0214025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2112  diaminopimelate epimerase  60 
 
 		 285 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3160  diaminopimelate epimerase  55.63 
 
 		 310 aa  306  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000134357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0680  diaminopimelate epimerase  57.39 
 
 		 282 aa  292  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  46.34 
 
 		 286 aa  248  9e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2337  diaminopimelate epimerase  49.08 
 
 		 282 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2751  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 268 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  44.86 
 
 		 285 aa  228  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3790  diaminopimelate epimerase  42.46 
 
 		 268 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  39.3 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  38.14 
 
 		 355 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 277 aa  182  7e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.14 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 		 278 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  36.17 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  37.19 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  36 
 
 		 269 aa  175  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 323 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.27 
 
 		 280 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  34.27 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 279 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  35.79 
 
 		 278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 278 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  38.08 
 
 		 297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  37.94 
 
 		 288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.65 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  38.82 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  37.15 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.37 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  38.71 
 
 		 276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  32.01 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  36.17 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5499  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 292 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 274 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 309 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  34.31 
 
 		 269 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  33.72 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  33.72 
 
 		 284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0040  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697529 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  35.17 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 275 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  36.11 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>