More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2337 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2337  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 282 aa  574  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2112  diaminopimelate epimerase  49.81 
 
 		 285 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  50.38 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3160  diaminopimelate epimerase  46.44 
 
 		 310 aa  236  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000134357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0680  diaminopimelate epimerase  49.62 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3880  diaminopimelate epimerase  49.08 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.28993  normal  0.0214025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2751  diaminopimelate epimerase  41.33 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3790  diaminopimelate epimerase  37.97 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0468247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.51 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  35.32 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.18 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.42 
 
 		 279 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  36.67 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  35.74 
 
 		 283 aa  175  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 276 aa  175  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.8 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  34.32 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  36.67 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  36.26 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.71 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  36.84 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  35.98 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 285 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 278 aa  169  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  36.3 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  34.7 
 
 		 275 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  34.7 
 
 		 275 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  37.12 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  35.63 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 275 aa  168  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  36.76 
 
 		 276 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  35.09 
 
 		 282 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  34.19 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  37.31 
 
 		 279 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  34.33 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  35.82 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.96 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  34.33 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  35.96 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 		 292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.98 
 
 		 368 aa  166  5e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 276 aa  166  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.05 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  32.96 
 
 		 288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  34.69 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 288 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0182  diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.998768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  32.74 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  34.44 
 
 		 281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.83 
 
 		 288 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  35.83 
 
 		 281 aa  162  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.8 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  36.5 
 
 		 277 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  36.09 
 
 		 295 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  34.34 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  34.13 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 286 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  34.31 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  34.96 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  36.12 
 
 		 277 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  34.6 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0125  diaminopimelate epimerase  34.72 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  35.04 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>