More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0549 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 280 aa  577  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  73.21 
 
 		 282 aa  428  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  72.3 
 
 		 279 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  69.64 
 
 		 278 aa  416  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  69.18 
 
 		 281 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  68.46 
 
 		 281 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  68.46 
 
 		 281 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  67.5 
 
 		 280 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  55.71 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  52.26 
 
 		 334 aa  288  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  52.13 
 
 		 355 aa  275  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  53.36 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  51.06 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  48.56 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  48.76 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  48.93 
 
 		 277 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  47.04 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  49.3 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  48.39 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  48.41 
 
 		 279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  45.04 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  46.64 
 
 		 277 aa  250  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  45.04 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  46.98 
 
 		 278 aa  248  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  45.64 
 
 		 287 aa  248  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 280 aa  248  7e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  46.02 
 
 		 277 aa  248  9e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  45.67 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  43.97 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  43.42 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  44.68 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  43.68 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5289  diaminopimelate epimerase  48.39 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  44.09 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5228  diaminopimelate epimerase  48.39 
 
 		 287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 276 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  44.88 
 
 		 278 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5137  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.91439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 286 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0244  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0867905  normal  0.652879 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  42.11 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  46.1 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 281 aa  227  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  42.2 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  43.4 
 
 		 315 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 276 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 279 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 276 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  43.4 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  45.88 
 
 		 288 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  42.4 
 
 		 286 aa  222  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 284 aa  221  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5499  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 275 aa  221  9e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  44.14 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 275 aa  219  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  43.9 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  45.8 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 288 aa  218  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  40.21 
 
 		 276 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 275 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  43.1 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>