More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1694 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 284 aa  581  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  63.31 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  61.37 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  56.83 
 
 		 282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  55.71 
 
 		 278 aa  317  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  54.55 
 
 		 283 aa  316  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  55.76 
 
 		 282 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  55.96 
 
 		 278 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  53.17 
 
 		 279 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  54.51 
 
 		 278 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  54.87 
 
 		 278 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  54.51 
 
 		 278 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  52.28 
 
 		 287 aa  301  9e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  52.55 
 
 		 292 aa  297  1e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  53.99 
 
 		 280 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  53.05 
 
 		 277 aa  295  7e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  56.99 
 
 		 279 aa  294  9e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  54.32 
 
 		 279 aa  289  3e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  51.25 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  51.45 
 
 		 277 aa  287  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 288 aa  275  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  48.74 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  48.74 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 282 aa  271  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  47.65 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  47.65 
 
 		 288 aa  268  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  52.54 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  51.39 
 
 		 279 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  48.89 
 
 		 269 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  47.31 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  48.28 
 
 		 407 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 284 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  48.65 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  48.74 
 
 		 290 aa  248  7e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 280 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  43.43 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  46.13 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  45.52 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  45.58 
 
 		 323 aa  228  9e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  45.45 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 355 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  42.99 
 
 		 326 aa  224  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 284 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 284 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  43.51 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  43.26 
 
 		 277 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 288 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  43.86 
 
 		 284 aa  215  7e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  42.45 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  44.1 
 
 		 284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 284 aa  212  7e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 		 292 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  42.4 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  38.64 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  40.34 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 290 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  41.34 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  41.58 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  42.05 
 
 		 283 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 		 289 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 279 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  41.05 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  42.6 
 
 		 268 aa  205  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  47.64 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>