More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0204 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 295 aa  600  1e-170  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 283 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  42.66 
 
 		 284 aa  229  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  41.38 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 280 aa  221  8e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  42.32 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  42.37 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  41.98 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  38.64 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  43.99 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  41.87 
 
 		 269 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  41.98 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  38.64 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 288 aa  211  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  39.13 
 
 		 287 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  43.49 
 
 		 279 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  41.55 
 
 		 278 aa  208  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 278 aa  208  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  40.96 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  41.02 
 
 		 282 aa  205  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  39.39 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  40.8 
 
 		 276 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  39.25 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.97 
 
 		 278 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  41.03 
 
 		 272 aa  200  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  39.32 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  40.34 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  36.79 
 
 		 407 aa  195  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  35.71 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  39.12 
 
 		 274 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 279 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  38.54 
 
 		 284 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  39.38 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  36.91 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  38.51 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  37.33 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  38.54 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  37.04 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  37.04 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  34.81 
 
 		 277 aa  182  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  37.12 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  37.87 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 283 aa  181  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  36.61 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  36.64 
 
 		 288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  36.64 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  37.84 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 288 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 		 279 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  35.12 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  36.79 
 
 		 288 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  38.85 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  34.69 
 
 		 278 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 286 aa  175  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 		 286 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 295 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  38.05 
 
 		 286 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  37.97 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  32.78 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  35.12 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  37.29 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 		 276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0407  diaminopimelate epimerase  36.61 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  36.82 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2006  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0431  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 276 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.35 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  35.47 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  33.02 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1723  Diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.714915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  32.78 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  38.98 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.67 
 
 		 368 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  34.92 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 274 aa  169  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>