More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0454 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 279 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  58.09 
 
 		 274 aa  297  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  56.46 
 
 		 272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  54.65 
 
 		 277 aa  279  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  54.21 
 
 		 275 aa  278  1e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  52.92 
 
 		 274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  39.22 
 
 		 283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  39.43 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  38.54 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 288 aa  185  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  38.65 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 288 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  40.5 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  38.89 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  42.03 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  38.81 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  40.88 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  42.24 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  40.88 
 
 		 272 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  41.3 
 
 		 284 aa  178  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 269 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  40.29 
 
 		 278 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  39.57 
 
 		 278 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 280 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  38.6 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  38.55 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  41.58 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  41.57 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  38.95 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  37.94 
 
 		 277 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  38.62 
 
 		 355 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  36.65 
 
 		 277 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  37.24 
 
 		 287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  38.93 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 284 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  37.89 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  34.94 
 
 		 279 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  37.11 
 
 		 407 aa  160  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0671  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 309 aa  159  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00498295 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 280 aa  159  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 281 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  36.64 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  38.81 
 
 		 295 aa  158  9e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  37.15 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  38.46 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  35.76 
 
 		 288 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  34.74 
 
 		 292 aa  156  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  38.21 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  38.06 
 
 		 334 aa  155  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0113  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067838  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2069  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000531715  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  35.46 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  36.21 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  35.86 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 290 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 281 aa  152  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  37.86 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  35.89 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  37.05 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  35.66 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  36.52 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  37.06 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 292 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  34.49 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  34.84 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>