More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1382 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 279 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  55.96 
 
 		 277 aa  319  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  54.32 
 
 		 284 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  53.45 
 
 		 277 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  52.73 
 
 		 277 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  52.73 
 
 		 277 aa  305  7e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  53.45 
 
 		 280 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  50.35 
 
 		 287 aa  291  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  55.2 
 
 		 278 aa  288  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  52.46 
 
 		 283 aa  285  5e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  56.32 
 
 		 279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  51.99 
 
 		 278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  51.44 
 
 		 282 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 		 279 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  49.09 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  50.72 
 
 		 282 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  48.39 
 
 		 278 aa  268  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  50.54 
 
 		 278 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  51.97 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  49.11 
 
 		 282 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  50.93 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  47.16 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 288 aa  253  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  48.58 
 
 		 279 aa  253  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 288 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  48.58 
 
 		 288 aa  249  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  48.55 
 
 		 278 aa  249  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  53.05 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  44.73 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  48.58 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  51.07 
 
 		 284 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  47 
 
 		 281 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  42.03 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  46.64 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  42.66 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 280 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  46.4 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  44.77 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  38.31 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  45.17 
 
 		 284 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  43.79 
 
 		 334 aa  215  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  43.2 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  47.14 
 
 		 278 aa  215  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  44.8 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  45.68 
 
 		 277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  44.83 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 368 aa  211  7.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  41.34 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  46.01 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  42.65 
 
 		 279 aa  208  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  44.77 
 
 		 274 aa  206  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 355 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  43.11 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  42.4 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3228  diaminopimelate epimerase  42.24 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0035809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  43.12 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 276 aa  202  4e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  43.84 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  42.24 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 275 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  43.07 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  43.12 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>