More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_08761 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  51.61 
 
 
323 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  52.86 
 
 
284 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  52.86 
 
 
284 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 
368 aa  278  6e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 
355 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  45.23 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  45.23 
 
 
281 aa  251  7e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  45.91 
 
 
282 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 
281 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  44.18 
 
 
407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 
279 aa  235  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  44.88 
 
 
286 aa  232  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  44.93 
 
 
278 aa  232  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  45.07 
 
 
286 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 
284 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  43.57 
 
 
280 aa  228  7e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 
286 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  43.39 
 
 
334 aa  223  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 
283 aa  215  8e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 
283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  44.1 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  41.99 
 
 
280 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 
278 aa  208  7e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 
277 aa  208  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  42.09 
 
 
274 aa  208  8e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  40.35 
 
 
280 aa  207  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 
278 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  41.05 
 
 
277 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  40.7 
 
 
277 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  41.24 
 
 
277 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  39.24 
 
 
287 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  38.95 
 
 
278 aa  201  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  40.35 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  38.14 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  38.14 
 
 
387 aa  199  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  37.8 
 
 
309 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  40.48 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  39.37 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  38.95 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  37.67 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  37.67 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  39.36 
 
 
277 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 
275 aa  196  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  38.38 
 
 
275 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 
282 aa  195  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 
276 aa  195  6e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  39.02 
 
 
279 aa  194  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
275 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 
278 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
275 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
275 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
275 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  40 
 
 
278 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 
290 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 
287 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 
282 aa  191  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  35.54 
 
 
288 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  37.11 
 
 
289 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 
297 aa  190  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 
268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 
276 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  36.55 
 
 
286 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 
281 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  36.05 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 
315 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  37.29 
 
 
292 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  38.81 
 
 
276 aa  187  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  38.73 
 
 
284 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  36.74 
 
 
326 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  39.1 
 
 
279 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 
269 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  37.68 
 
 
279 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  39.15 
 
 
278 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 
278 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0183  diaminopimelate epimerase  41.24 
 
 
276 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  37.37 
 
 
277 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  36.36 
 
 
288 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  38.52 
 
 
276 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 
274 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  36.71 
 
 
279 aa  186  4e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 
292 aa  186  5e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 
276 aa  185  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  40 
 
 
279 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  36.15 
 
 
287 aa  185  9e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  37.85 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  37.63 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  37.19 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  38.03 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  37 
 
 
299 aa  183  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0224  diaminopimelate epimerase  40.55 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 
274 aa  181  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>