More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3074 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 279 aa  580  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  78.83 
 
 		 278 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  78.34 
 
 		 278 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  77.37 
 
 		 278 aa  455  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  76.64 
 
 		 278 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  74.82 
 
 		 278 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  75.27 
 
 		 282 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  72.66 
 
 		 282 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  57.19 
 
 		 280 aa  326  2.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  56.79 
 
 		 280 aa  323  2e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  56.47 
 
 		 277 aa  318  5e-86  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  55.4 
 
 		 277 aa  315  5e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  54.68 
 
 		 277 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  53.17 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  54.87 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 		 288 aa  302  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  51.64 
 
 		 304 aa  301  7.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 283 aa  298  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  54.51 
 
 		 278 aa  298  9e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  52.84 
 
 		 287 aa  298  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 		 279 aa  297  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  52.73 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 288 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 288 aa  294  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  52.67 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  52.67 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  52.67 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  52.67 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  52.67 
 
 		 288 aa  293  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  52.31 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  52.67 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  52.31 
 
 		 288 aa  290  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  47.46 
 
 		 278 aa  281  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 		 279 aa  278  5e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  51.43 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  52.17 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  48.01 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  48.21 
 
 		 280 aa  251  6e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  48.93 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 278 aa  249  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 279 aa  248  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  48.41 
 
 		 280 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  46.85 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  43.49 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  45.58 
 
 		 281 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  45.23 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  43.15 
 
 		 407 aa  224  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  42.11 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  43.68 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  42.6 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  41.46 
 
 		 288 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  44.24 
 
 		 283 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  40.83 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  41.05 
 
 		 292 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  39.64 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  43.49 
 
 		 295 aa  209  6e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  42.29 
 
 		 297 aa  208  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  42.29 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  41.05 
 
 		 292 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 284 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  41.01 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 387 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  38.62 
 
 		 315 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  40.48 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  41.4 
 
 		 293 aa  206  4e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  41.52 
 
 		 276 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 292 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  40.42 
 
 		 368 aa  205  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  40.43 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  41.49 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  39.35 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 285 aa  203  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  41.45 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  41.13 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  40.57 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 287 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  40.5 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>