More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3907 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 283 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  59.06 
 
 		 277 aa  333  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  54.55 
 
 		 284 aa  316  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  52.9 
 
 		 280 aa  310  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  59.93 
 
 		 279 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  51.09 
 
 		 277 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  50.36 
 
 		 277 aa  301  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  48.91 
 
 		 292 aa  301  9e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  54.09 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  55.96 
 
 		 278 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 277 aa  299  4e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 278 aa  299  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  53.41 
 
 		 278 aa  298  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  53.02 
 
 		 279 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  52.88 
 
 		 278 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  53.74 
 
 		 282 aa  297  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  52.65 
 
 		 278 aa  294  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  53.57 
 
 		 278 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  52.3 
 
 		 287 aa  285  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  52.65 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 284 aa  278  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  51.06 
 
 		 281 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  51.8 
 
 		 278 aa  272  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  50.35 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  45.82 
 
 		 288 aa  268  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  46.55 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  46.74 
 
 		 304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 281 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  44.36 
 
 		 279 aa  267  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  50.87 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  52.46 
 
 		 279 aa  265  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  45.45 
 
 		 288 aa  265  8e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  45.45 
 
 		 288 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  48.75 
 
 		 279 aa  263  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 288 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  44.73 
 
 		 288 aa  262  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  45.09 
 
 		 288 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  46.3 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  47.42 
 
 		 407 aa  256  3e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  49.13 
 
 		 368 aa  251  7e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  46.01 
 
 		 284 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  48.78 
 
 		 355 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 278 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  47.02 
 
 		 323 aa  236  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  47.48 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 295 aa  232  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  43.48 
 
 		 299 aa  231  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  45 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  46.24 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 279 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 275 aa  218  7e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 275 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  46.04 
 
 		 277 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  44.56 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 284 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  44.84 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  41.73 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  39.35 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  42.01 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 284 aa  215  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  42.81 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  41.7 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  43.17 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  43.43 
 
 		 315 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  42.27 
 
 		 326 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  43.71 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  43.4 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  41.49 
 
 		 278 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  40.48 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 289 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  41.99 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  46.4 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 286 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  41.99 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  42.27 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>