More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11570 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 284 aa  588  1e-167  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  52.98 
 
 		 282 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  47 
 
 		 280 aa  278  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  50.88 
 
 		 283 aa  278  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  49.82 
 
 		 279 aa  278  7e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 284 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  49.1 
 
 		 277 aa  275  8e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  48.55 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  50.53 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  48.58 
 
 		 281 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  48.23 
 
 		 281 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  47.87 
 
 		 278 aa  266  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  47.52 
 
 		 280 aa  263  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  47.69 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  48.01 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  52.16 
 
 		 279 aa  258  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  47.31 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  46.93 
 
 		 274 aa  258  9e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  46.26 
 
 		 278 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  46.83 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  46.79 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  46.59 
 
 		 282 aa  255  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  46.24 
 
 		 282 aa  254  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  45.17 
 
 		 277 aa  254  8e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  46.26 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  47.04 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  48.76 
 
 		 280 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  45.17 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  46.26 
 
 		 288 aa  252  6e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  46.81 
 
 		 288 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  46.81 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  46.81 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  45.8 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  46.81 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  46.81 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  46.81 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  45.94 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  46.45 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  46.81 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  45.16 
 
 		 292 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  46.45 
 
 		 288 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  44.44 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 304 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  44.88 
 
 		 368 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  45.74 
 
 		 288 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  47.2 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  41.64 
 
 		 407 aa  242  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  46.15 
 
 		 278 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.62 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  46.15 
 
 		 269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  41.5 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  45.42 
 
 		 276 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  43.77 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  41.16 
 
 		 292 aa  235  8e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  46.02 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  42.76 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  43.3 
 
 		 387 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  43.64 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  43.9 
 
 		 287 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  44.29 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  45.58 
 
 		 281 aa  232  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  44.6 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  43.2 
 
 		 295 aa  231  8.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  43.3 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  43.64 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  43.64 
 
 		 309 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  46.48 
 
 		 279 aa  231  9e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  41.5 
 
 		 292 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  43.01 
 
 		 274 aa  231  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  44.17 
 
 		 284 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  42.66 
 
 		 295 aa  229  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  43.66 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  42.31 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  41.92 
 
 		 289 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  42.96 
 
 		 289 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  42.61 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  41.08 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  41.94 
 
 		 274 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  43.29 
 
 		 299 aa  226  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  42.57 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  43.53 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  41.22 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  41.22 
 
 		 274 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>