More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5143 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  74.02 
 
 		 281 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  73.67 
 
 		 281 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  73.65 
 
 		 282 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  70.14 
 
 		 278 aa  417  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  69.53 
 
 		 279 aa  411  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  69.18 
 
 		 280 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  64.77 
 
 		 280 aa  381  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  57.09 
 
 		 407 aa  338  7e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  51.57 
 
 		 334 aa  294  1e-78  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  48.92 
 
 		 274 aa  275  7e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  51.06 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 284 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 277 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  53 
 
 		 279 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  49.29 
 
 		 277 aa  265  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  48.93 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  48.57 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  48.07 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  48.04 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  46.26 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  46.18 
 
 		 287 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  47.02 
 
 		 355 aa  251  9.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  45.04 
 
 		 278 aa  248  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  45.45 
 
 		 278 aa  246  3e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  44.37 
 
 		 280 aa  246  4e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  44.13 
 
 		 282 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  43.55 
 
 		 282 aa  240  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  44.48 
 
 		 286 aa  238  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  46.64 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  43.42 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  46.85 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 284 aa  236  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  43.06 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  46.95 
 
 		 279 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  47.16 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 286 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  45.39 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  44.13 
 
 		 278 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  45.32 
 
 		 277 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  42.51 
 
 		 278 aa  229  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  44.57 
 
 		 278 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  43.26 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  42.55 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3739  diaminopimelate epimerase  46.21 
 
 		 278 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351695 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3266  diaminopimelate epimerase  41.51 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0214186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  43.88 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  42.86 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  44.01 
 
 		 288 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  42.11 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  42.35 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  43.21 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  41.96 
 
 		 288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  43.16 
 
 		 288 aa  219  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  41.34 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  40.65 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  41.94 
 
 		 281 aa  216  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  43.82 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  40.91 
 
 		 288 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  46.1 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  43.46 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  45.04 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  40.28 
 
 		 290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  39.79 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  44.64 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>