More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1883 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
249 aa  520  1e-147  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  97.19 
 
 
249 aa  508  1e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  95.98 
 
 
249 aa  504  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  65.06 
 
 
249 aa  323  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  54.07 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  55.28 
 
 
247 aa  265  5e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  50.61 
 
 
247 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  52.44 
 
 
249 aa  249  3e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  50.2 
 
 
257 aa  247  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  48.5 
 
 
272 aa  240  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 
247 aa  215  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  36.67 
 
 
287 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  37.09 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 
259 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 
274 aa  141  9e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 
257 aa  139  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  39.22 
 
 
258 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  32.44 
 
 
260 aa  135  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 
279 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 
264 aa  131  9e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  35.27 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 
282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  34.59 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  31.03 
 
 
270 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  31.97 
 
 
268 aa  125  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  33.2 
 
 
281 aa  125  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  32.21 
 
 
272 aa  125  7e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 
261 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 
292 aa  123  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  35.81 
 
 
261 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  35.19 
 
 
261 aa  122  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  31.5 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  33.84 
 
 
283 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  32.33 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  30.11 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  32.93 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  29.96 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  32.11 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  29.09 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  29.56 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 
278 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  30.33 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  30.33 
 
 
278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  28.06 
 
 
277 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  29.79 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  29.39 
 
 
280 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  26.98 
 
 
277 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  31.28 
 
 
276 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  33.75 
 
 
260 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 
236 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 
236 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  28 
 
 
278 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  27.7 
 
 
277 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  28.1 
 
 
278 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  28.01 
 
 
282 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  30.61 
 
 
272 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 
280 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  32.89 
 
 
284 aa  105  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  28.72 
 
 
282 aa  105  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  28 
 
 
282 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  29.58 
 
 
274 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  27.96 
 
 
284 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  34.12 
 
 
272 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 
260 aa  104  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  27.86 
 
 
281 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  26.95 
 
 
281 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  32.55 
 
 
272 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  29.6 
 
 
284 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0670  diaminopimelate epimerase  33.63 
 
 
284 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  29.6 
 
 
284 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31.54 
 
 
286 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  29.45 
 
 
278 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  27.34 
 
 
277 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  26.6 
 
 
281 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  28.42 
 
 
292 aa  102  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_647  diaminopimelate epimerase  32 
 
 
284 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.55502  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 
278 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 
273 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  27.47 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  29.97 
 
 
334 aa  99.4  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  28.78 
 
 
308 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  28.32 
 
 
278 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  28.36 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  29.03 
 
 
280 aa  98.2  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  25.99 
 
 
277 aa  97.1  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  29.32 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  30.7 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  27.54 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  28.09 
 
 
267 aa  96.3  4e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  27.34 
 
 
280 aa  95.9  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  26.1 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  29.02 
 
 
284 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  28.14 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 
279 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>