More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0648 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  55.93 
 
 		 283 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  54.81 
 
 		 282 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  54.81 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  54.55 
 
 		 281 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  43.45 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  41.79 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  41.91 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  39.78 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  39.18 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  38.11 
 
 		 260 aa  175  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  39.85 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  36.09 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  39.93 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  37.36 
 
 		 292 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  37.12 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  36.67 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  38.81 
 
 		 274 aa  155  8e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  37.31 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 		 264 aa  152  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  36.92 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  35.41 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  35.61 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.13 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 		 280 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  36.19 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  38.43 
 
 		 258 aa  143  4e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  32.01 
 
 		 277 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 281 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  37.1 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 		 283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 		 279 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 290 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  33.59 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 249 aa  138  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  36.17 
 
 		 278 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  34.64 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  34.29 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  31.88 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0204  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 295 aa  135  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.164402  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 355 aa  135  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.87 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  32.82 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  33.8 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  34.89 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  36.62 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  31.79 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  34.08 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  35.07 
 
 		 273 aa  132  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  35.54 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  32.61 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.09 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  33.94 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  33.46 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 286 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  30.11 
 
 		 285 aa  129  7.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  33.93 
 
 		 288 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  29.68 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  34.26 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  30.96 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.61 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  31.43 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  32.49 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 		 387 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  29.68 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  32.01 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  31.32 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  31.16 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>