More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0107 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 272 aa  551  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  99.18 
 
 		 247 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  51.69 
 
 		 247 aa  278  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  54.89 
 
 		 247 aa  271  1e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  51.52 
 
 		 249 aa  261  6e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  53.38 
 
 		 257 aa  258  7e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  50.19 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  49.25 
 
 		 249 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  48.87 
 
 		 249 aa  242  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  48.5 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  48.5 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.13 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  36.8 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  32.88 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  30.9 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  32.55 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  30.07 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  31.71 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  31.37 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  34.62 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  34.22 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  35 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  30.34 
 
 		 266 aa  115  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  32.48 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  27.49 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  27.49 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  28.08 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  33.08 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  35.9 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  27.15 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  27.74 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  27.3 
 
 		 277 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  32.16 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  29.73 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  29.66 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  32.34 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  29.92 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  31.23 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  31.89 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  28.33 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  29.25 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  30.3 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  30.07 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  29.35 
 
 		 279 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  29.87 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  25.17 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  29.59 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  28.08 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  29.92 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  29.46 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  30.95 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  28.73 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  30.61 
 
 		 272 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  27.27 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  29.49 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  26.3 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  35.08 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  35.08 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  25.41 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  26.71 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  30.35 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  30.48 
 
 		 284 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  25.61 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  28.14 
 
 		 279 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  28.86 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  27.05 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  27.12 
 
 		 299 aa  96.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  25.08 
 
 		 281 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  29.37 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  31.13 
 
 		 258 aa  95.9  6e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  26.69 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  29.69 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  25.64 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  27.42 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_002620  TC0714  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 278 aa  92.8  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  26.9 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  28.12 
 
 		 297 aa  92  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  24.91 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  25.26 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  27.27 
 
 		 278 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  25.87 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  24.41 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  25.59 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  27.64 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  31.76 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  25.87 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  25.87 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>