More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0492 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  99.18 
 
 		 272 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  50.62 
 
 		 247 aa  248  9e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  54.17 
 
 		 247 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  50.42 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  53.75 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  48.95 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  48.33 
 
 		 249 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  47.92 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  47.5 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  42.4 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.1 
 
 		 287 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  40.72 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  35.86 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  32.38 
 
 		 279 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  32.42 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  34.51 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  34.3 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  30.42 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  35.2 
 
 		 257 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  33.06 
 
 		 283 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 259 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  29.66 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  33.99 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  30.83 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  28.19 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  30.08 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  31.02 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  26.59 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  31.92 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  30.35 
 
 		 279 aa  98.6  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  27.14 
 
 		 280 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  35.08 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  30.89 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  35.08 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  30.62 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  27.38 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  27 
 
 		 277 aa  96.7  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  33.48 
 
 		 274 aa  96.7  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  27.92 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  27.38 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  30.7 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  31.82 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  27.17 
 
 		 277 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  29.15 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  33.19 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  29.96 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  31.55 
 
 		 264 aa  92  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  27.65 
 
 		 278 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  28.68 
 
 		 282 aa  92  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  31.86 
 
 		 278 aa  91.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  31.22 
 
 		 272 aa  91.3  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  29.75 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  30.97 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  26.82 
 
 		 277 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  30.12 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  27.61 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  36.68 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  29 
 
 		 278 aa  89.7  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0714  diaminopimelate epimerase  34.18 
 
 		 269 aa  89.4  5e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  24.54 
 
 		 281 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  29.41 
 
 		 275 aa  89.4  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  32.34 
 
 		 278 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  30.22 
 
 		 278 aa  89  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  30.94 
 
 		 272 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  27.44 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  26.92 
 
 		 290 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  29.87 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  26.62 
 
 		 304 aa  85.1  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  30.57 
 
 		 272 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  29.25 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  25.29 
 
 		 274 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  29.06 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  32.14 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  26.17 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  25.29 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  26.17 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  26.17 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  26.54 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  27.17 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  26.17 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  28.85 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  26.17 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  24.52 
 
 		 274 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  29.46 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  30.8 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  26.87 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  25.76 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  25.71 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  24.9 
 
 		 286 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  28.82 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  24.9 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  28.64 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  32.79 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  25.39 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  25.39 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  25.39 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>