More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2622 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  100 
 
 
260 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 
277 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  37.13 
 
 
280 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  36.46 
 
 
277 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 
283 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  36.2 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  35.11 
 
 
284 aa  165  9e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  35.31 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 
280 aa  162  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 
277 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  36.23 
 
 
278 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.77 
 
 
292 aa  158  7e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  38.25 
 
 
282 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 
304 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 
279 aa  156  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  36.17 
 
 
281 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 
269 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  34.17 
 
 
278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 
278 aa  152  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 
281 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  36.49 
 
 
281 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  36.75 
 
 
280 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 
279 aa  151  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 
282 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 
355 aa  149  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  40.23 
 
 
262 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  36.86 
 
 
277 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  34.52 
 
 
278 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 
278 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  34.53 
 
 
282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  34.4 
 
 
368 aa  144  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 
272 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 
278 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 
272 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 
288 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 
276 aa  142  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  34.3 
 
 
278 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 
289 aa  141  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  34.28 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  36.21 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  34.23 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  31.03 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 
274 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  35.48 
 
 
290 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  31.91 
 
 
288 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  38.32 
 
 
276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 
288 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 
288 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 
288 aa  139  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 
288 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  30.82 
 
 
407 aa  138  7e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 
288 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 
288 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 
289 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 
288 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 
292 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 
288 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  35.97 
 
 
292 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 
289 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 
289 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  32.27 
 
 
288 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 
289 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 
288 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 
289 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  35.34 
 
 
289 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  34.63 
 
 
308 aa  137  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35 
 
 
277 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  32.07 
 
 
286 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  34.55 
 
 
315 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  35.29 
 
 
274 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2730  diaminopimelate epimerase  36.5 
 
 
268 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0948067  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0859  diaminopimelate epimerase  36.4 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  34.78 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 
284 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 
275 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  35.38 
 
 
275 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  34.06 
 
 
275 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  34.06 
 
 
275 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  33.7 
 
 
278 aa  135  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  34.06 
 
 
275 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  34.06 
 
 
275 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 
275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  35.02 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  37.91 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  32.4 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0740  diaminopimelate epimerase  34.39 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00112553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 
279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0318  diaminopimelate epimerase  36.74 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47710  diaminopimelate epimerase  37.96 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 
323 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  30.34 
 
 
286 aa  133  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6021  diaminopimelate epimerase  36.96 
 
 
276 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69690  diaminopimelate epimerase  36.96 
 
 
276 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0119345  normal  0.292475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  35.4 
 
 
274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>