More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1404 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 278 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  85.82 
 
 		 280 aa  454  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  57.45 
 
 		 270 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  53.99 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  55.56 
 
 		 277 aa  247  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  54.45 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  56.03 
 
 		 273 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  54.95 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  52.73 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  54.17 
 
 		 302 aa  224  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  50.5 
 
 		 319 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  50.17 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  49.32 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  50.17 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  50.35 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  48.48 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  51.76 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  48 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  48 
 
 		 293 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  51.88 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 313 aa  202  7e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  47.28 
 
 		 289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  52.1 
 
 		 307 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  47.47 
 
 		 309 aa  188  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  48.94 
 
 		 293 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  44.75 
 
 		 302 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  48.68 
 
 		 313 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  48.32 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  44.67 
 
 		 303 aa  178  8e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  43.65 
 
 		 314 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  48.08 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.61 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  45.48 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  35.84 
 
 		 293 aa  141  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  34.02 
 
 		 278 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.77 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  35.49 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  36.03 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  35.81 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  34.23 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  34.1 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  37.95 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  31.96 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  34.24 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  36.81 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0316  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  34.11 
 
 		 279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.37 
 
 		 279 aa  128  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  37.21 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  36.58 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.95 
 
 		 279 aa  125  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.76 
 
 		 281 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.54 
 
 		 282 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  32.21 
 
 		 283 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  37.01 
 
 		 254 aa  124  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  30.87 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  35.62 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 278 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  28.52 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.15 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  32.66 
 
 		 288 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  32.77 
 
 		 304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 280 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  31.53 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  33.66 
 
 		 287 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0266  diaminopimelate epimerase  35.64 
 
 		 276 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  29.87 
 
 		 286 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  30.64 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  28.19 
 
 		 284 aa  118  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  31.27 
 
 		 276 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0445  diaminopimelate epimerase  34.35 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>