More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2150 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  99.66 
 
 		 313 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  77.66 
 
 		 289 aa  411  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  75.17 
 
 		 289 aa  404  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  73.97 
 
 		 289 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  56.16 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  59.72 
 
 		 290 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  51.69 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  52.45 
 
 		 270 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  54.48 
 
 		 277 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  49.83 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  48.11 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  49.3 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  48.96 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  48 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  48.44 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  46.96 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  48.1 
 
 		 302 aa  206  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  46.23 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  42.48 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  46.6 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  44.37 
 
 		 271 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  44.41 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  45.03 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  40.33 
 
 		 317 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  39.76 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  42.07 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  42.25 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  38.87 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  39.74 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  37.5 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  41.61 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  31.13 
 
 		 284 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  39.94 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  40.14 
 
 		 254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.23 
 
 		 278 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.7 
 
 		 281 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.11 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  28.48 
 
 		 285 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  28.17 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  32 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  29.53 
 
 		 276 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  30.49 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  31.37 
 
 		 281 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 280 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  32.17 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  29.75 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  30.72 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  29.43 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  30.33 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  32.17 
 
 		 315 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  32.6 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  27.18 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3160  diaminopimelate epimerase  29.7 
 
 		 310 aa  106  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000134357  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  27.21 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  27.21 
 
 		 272 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  27.43 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  25.84 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  29 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  29 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  29 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  29 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  29 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  29.62 
 
 		 323 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  30.82 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  28.36 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  26.58 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4269  diaminopimelate epimerase  28.25 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  36.14 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03685  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.163573  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4170  Diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.837067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4175  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0210737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03634  hypothetical protein  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.191697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4328  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5248  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  28.85 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4198  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4034  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  29.74 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  26.1 
 
 		 292 aa  103  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  27.78 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  26.12 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  29.04 
 
 		 281 aa  102  8e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  28.12 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  28.08 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  29.74 
 
 		 278 aa  102  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  24.25 
 
 		 286 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  25.84 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  25.17 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  29.8 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>