More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1799 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 290 aa  557  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  62.68 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  62.14 
 
 		 289 aa  295  6e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  59.72 
 
 		 293 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  59.72 
 
 		 293 aa  291  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  59.72 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  59.11 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  60.79 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  52.1 
 
 		 272 aa  255  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  52.65 
 
 		 277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  51.94 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  51.88 
 
 		 278 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  50.34 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  52.28 
 
 		 271 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  52.98 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  49.47 
 
 		 268 aa  225  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 281 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  48.28 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  45.94 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  43.83 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  45.63 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  48.76 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 304 aa  179  5.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  41.4 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  44.33 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  46.32 
 
 		 279 aa  175  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  45.86 
 
 		 321 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  44.56 
 
 		 282 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  41.7 
 
 		 314 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  40.68 
 
 		 314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  41.27 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 278 aa  128  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  37.72 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  32.32 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  35.59 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  34.9 
 
 		 284 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1183  diaminopimelate epimerase  34.9 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147631  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  32.13 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 275 aa  112  9e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  30.33 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  31.39 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  31.4 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  32.32 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  32.43 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  30.07 
 
 		 286 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  29.69 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0171  Diaminopimelate epimerase  25.34 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  27.72 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  33.78 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0778  Diaminopimelate epimerase  28 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.961561  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  29.87 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0026  diaminopimelate epimerase  29.08 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  31.13 
 
 		 282 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  33.67 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 277 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  28.12 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  28.12 
 
 		 272 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.74 
 
 		 279 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2622  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  31.06 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  31.77 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  30.67 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  27.42 
 
 		 279 aa  103  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  29.43 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  34.58 
 
 		 278 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  30.16 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  27.52 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  29.47 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  27.85 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  27.65 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  29.8 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0050  diaminopimelate epimerase  27.95 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.184283  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  27.88 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  32.09 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3160  diaminopimelate epimerase  31.53 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000134357  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.19 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  30.85 
 
 		 280 aa  100  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  27.01 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2751  diaminopimelate epimerase  30.58 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  27.48 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  30.64 
 
 		 279 aa  99.8  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  30.98 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  29.45 
 
 		 268 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  29.51 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>