More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0816 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 274 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  74.44 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  62.23 
 
 		 273 aa  305  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  57.72 
 
 		 268 aa  278  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  56.3 
 
 		 270 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  52.33 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  50.69 
 
 		 302 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  50.89 
 
 		 302 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  53.65 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  49.64 
 
 		 289 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  49.48 
 
 		 289 aa  224  8e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  50.71 
 
 		 278 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  48.96 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  48.96 
 
 		 293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  50.18 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  48.61 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  50.7 
 
 		 280 aa  208  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  51.06 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  52.24 
 
 		 271 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  47.37 
 
 		 289 aa  204  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  46.13 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  49.65 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  47.89 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  45.54 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  46.53 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  44.3 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  47.52 
 
 		 321 aa  185  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  46.1 
 
 		 313 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  45.03 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 		 282 aa  179  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  41.88 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  42.38 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  42.28 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  35.81 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  42.26 
 
 		 321 aa  142  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 272 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 286 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.03 
 
 		 280 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  32.87 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  35.96 
 
 		 278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 278 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 275 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  32.99 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 276 aa  126  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  37.41 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  35.69 
 
 		 323 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3245  diaminopimelate epimerase  36.48 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 288 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  34.55 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  31.94 
 
 		 276 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.14 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 281 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  35.1 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  32.32 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3249  diaminopimelate epimerase  34.48 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  32.33 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  30.63 
 
 		 269 aa  118  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 280 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  29.21 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  32.43 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  31.47 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  34.21 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  34.69 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  31.6 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0445  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  31.35 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  31.12 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  31.49 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.14 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  30.77 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  31.12 
 
 		 274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  32.89 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 387 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  32.43 
 
 		 286 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.46 
 
 		 283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0040  diaminopimelate epimerase  32.52 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697529 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  31.83 
 
 		 278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>