More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_07270 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 317 aa  634    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  65.31 
 
 		 314 aa  362  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  63.95 
 
 		 314 aa  355  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  55.08 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  54.1 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  50.49 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  52.58 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  55.48 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  50.17 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  50 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  47.47 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  45.21 
 
 		 293 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  48.32 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  46.82 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  47.01 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  43.58 
 
 		 268 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  47.67 
 
 		 285 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  45.03 
 
 		 274 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  45.48 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  42.3 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  39.22 
 
 		 297 aa  172  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  43.81 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  45.82 
 
 		 273 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  45.37 
 
 		 279 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  44.3 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  42.04 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  45.34 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  40.19 
 
 		 313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  42.21 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  40.33 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  40.33 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  39.74 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  36.77 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  32.48 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  35.43 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  36.48 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  32.58 
 
 		 277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0200  diaminopimelate epimerase  32.45 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000663087 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  32.48 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  32.5 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  35.81 
 
 		 355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  35.28 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 281 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0349  diaminopimelate epimerase  31.13 
 
 		 293 aa  127  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000570655  hitchhiker  0.0000127535 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0220  diaminopimelate epimerase  31.46 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  36.07 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  36.72 
 
 		 287 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 278 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  34.97 
 
 		 279 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  33.77 
 
 		 284 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  35.1 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  36.04 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  33.11 
 
 		 284 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  34.49 
 
 		 407 aa  123  4e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  33.55 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  36.81 
 
 		 278 aa  122  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  34.44 
 
 		 274 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  33.12 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  37.25 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  32.68 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  35.43 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.79 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  32.89 
 
 		 277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  32.46 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  35.44 
 
 		 287 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  31.48 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  35.53 
 
 		 278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3113  diaminopimelate epimerase  35.95 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.534786  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  35.78 
 
 		 277 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 284 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  33.02 
 
 		 286 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00205  diaminopimelate epimerase  31.42 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  34.18 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34 
 
 		 283 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1913  Diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  33.23 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  31.46 
 
 		 281 aa  113  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  30.56 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  32.35 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0378  diaminopimelate epimerase  32.24 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2743  diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0353205  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2363  Diaminopimelate epimerase  33.9 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000154753  hitchhiker  0.00000000163815 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002111  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0126  diaminopimelate epimerase  32.01 
 
 		 276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>